Inaugurado en 2011 a partir de la evolución del Museo Comarcal del Montsià tiene su sede en Amposta.

Las exposiciones permanentes "Las Tierras del Ebro: de la prehistoria a la edad media" y "El Ebro camino de agua" y el Espacio natural multimedia presentan la memoria y la identidad de un territorio y una sociedad determinadas por su riqueza natural, su diversidad de formas de vida y su situación junto al Ebro.

El museo lidera la red "Ebre, natura & cultura" que aglutina museos, centros de interpretación, yacimientos y monumentos en distintos municipios y otros servicios para descubrir un territorio singular.